Не понял. Имеется ввиду плата синтезатора? Да, конечно, а основная плата радиоканала может пока и не подключаться, управление синтезатором должно запуститься и работать без нее.
Да, еще. Плата синтезатора должна быть включена, на нее должно подаваться 5 вольт питания. Программатор питается от нее (не наоборот!!!). Если Плата синтезатора не запитана, как раз будет такой эффект как у Вас.